Plateforme de biologie moléculaire
La Plateforme de Biologie Moléculaire a été créée en 2006. Elle fait l’objet d’une collaboration étroite entre les établissements du Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU) et du Centre Oscar Lambret (COL). Elle permet aux équipes de ces établissements de réaliser des tests innovants dans le cadre du traitement contre le cancer.
Objectifs et tests au sein de la Plateforme de Biologie Moléculaire : Les analyses réalisées au sein de la Plateforme de Biologie Moléculaire ont pour but d‘améliorer les diagnostics et les traitements proposés aux patients atteints de tumeurs cancéreuses.
« Réaliser des tests moléculaires pour la prise en charge personnalisée des patients atteints de cancer »
Principaux objectifs
Affinage du diagnostic
Meilleure stratification des patients
Identification des marqueurs moléculaires permettant de proposer un traitement personnalisé : prescription d’inhibiteurs de tyrosines kinases, prescription d’inhibiteurs de PARP (cancer des ovaires), immunothérapie
Suivi de la masse tumorale et de la survenue de résistances après traitement
Mise en oeuvre
L’analyse de tissus tumoraux par les équipes de la Plateforme de Biologie Moléculaire est le résultat d’une étroite collaboration entre différents partenaires :
« Une approche multidisciplinaire : Collaboration étroite entre les différents partenaires »
1. Ce processus débute par une demande de test de la part du clinicien en charge du patient. Cette demande peut provenir d’un Centre Hospitalier, Centre Hospitalier Universitaire, Centre de Lutte contre le Cancer ou Clinique.
2. Le médecin pathologiste, en charge du diagnostic, sélectionne l’échantillon de tumeur et l’envoie au Centre de Pathologie moléculaire adossé à la Plateforme.
3. Ce centre réalise un premier traitement de l’échantillon en effectuant un contrôle morphologique et des coupes qui sont transmises à la Plateforme de Biologie Moléculaire.
4. Enfin, la recherche de marqueurs moléculaires est réalisée et les résultats sont transmis aux différents acteurs médicaux : cliniciens, pathologistes et équipes du Centre de Pathologie Moléculaire.
Compétences mutualisées
La mise en œuvre de la Plateforme de Biologie Moléculaire requiert un haut niveau d’expertise et de technologie permis par la collaboration étroite entre le Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU) et le Centre Oscar Lambret (COL):
Des équipes de biologie et pathologie moléculaire
Équipes du COL :
Unité de Biologie moléculaire des hémopathies malignes
Unité de Biologie moléculaire des tumeurs solides
Unité de Cytogénétique oncohématologie
Unité de Pathologie moléculaire
Équipes du CHU :
Unité d’Oncologie Moléculaire Humaine
Unité de Pathologie Morphologique et Moléculaire
Une grande diversité d’outils
Séquençage capillaire :
séquençage Sanger : SNV
analyse de fragments : indel,CNV
Séquençage nouvelle génération (NGS) :
SNV, indel, CNV, fusions, méthylation ADN
PCR digitale (dPCR) :
SNV faible fréquence allélique
PCR temps réel :
CNV, SNV, transcrits de fusion
CGH array :
analyse comparative sur puces ADN : CNV
Pyroséquençage :
méthylation ADN
SNV, transcrits de fusion
nCounter analyser :
expression ARN
transcrits de fusion
FISH :
CNV, translocation